正常情況下，門窗是在生態木屋框架和屋蓋施工完畢后安裝的，一旦門窗安裝完畢，應對房屋上鎖，以保證安全。正確地安裝窗和外門非常重要的，特別是在窗或門框架和墻體框架之間的連接面上，如果此連接面上的保溫層、氣密層和蒸汽擴散阻隔層安裝不正確，便可能發生空氣泄漏、熱量泄漏和水汽冷凝和潮氣滯留等問題，生態木屋的性能、舒適度和耐用性將會打折扣。

生態木屋廠家案例圖

在風雨較多的地區，如上海，雨水滲透是相對較大的問題，必須正確設計和安裝泛水板；必須在窗下方正確安裝防水覆面膜和泛水板，以將雨水安全排走；窗與外墻接縫之間也必須充分密封，放止雨水透入。同樣重要的是，墻體開口框架的尺寸必須正好和預購的門窗大小一致，否則，安裝門窗的成本會很高，過程也會變得復雜。在墻體框架施工前和施工中，還應充分理解和遵守門窗制造商提供的安裝說明，各種與門窗安裝有關的因素應該在前期計劃過程中提前給予考慮。

防水材料是生態木屋建造中一個相對較少的材料，主要用于衛生間，廚房墻地面處理，和屋頂防水，以及我們前面說到的地墊木防水。

常規生態木屋中，防水卷材對成本影響相對較小，而相對較大的是用于屋頂的屋面瓦。瀝青瓦是生態木屋建筑中最常見的屋頂材料，有單層雙層之分，單層價格30-40/平米，雙層價格40-50/平米（參考價格，具體以當時當地而定）

根據生態木屋具體要求不同，可能還會采用的材料包括，青瓦，金屬瓦，金屬茅草等。成本根據不同材料，不同屋頂結構形式差異巨大。

石膏板：用于生態木屋內墻裝飾層，起防火作用為主，對生態木屋成本影響較小。需要注意的是：廚衛地區，需采用防水石膏板施工。有些項目可能選擇不做石膏板，直接在墻骨柱上安裝內墻板。